Najpogostejše težave pri odvzemu so:

• Zob brez zobne pulpe (zobna pulpa je že absorbirana)
• Zaradi zobne gnilobe ali kakorkoli poškodovanega zoba ni mogoče izolirati zobne pulpe
• Kljub uspešni ekstrakciji zobne pulpe v laboratoriju ne uspemo izolirati matičnih celic